Código propuesto como respuesta al ejercicio CU00662B:
import java.util.*;
public class Comparadora{
	
	public static void main(String [] args){
		
		String cadena1="";
		
		Scanner Escaner1=new Scanner(System.in);
		
		System.out.println("Introduce la primera palabra:");
		String Palabra1=Escaner1.nextLine();
		
		System.out.println("Introduce la segunda palabra:");
		String Palabra2=Escaner1.nextLine();
		
		for(int i=0;i<Palabra1.length()||i<Palabra2.length();i++){
			
			if(Palabra1.length()>=i+1 && Palabra2.length()>=i+1)
				 {cadena1=""+Palabra1.substring(i,i+1).equals(Palabra2.substring(i,i+1));}
				 
			else if(Palabra1.length()<i+1)
				 {cadena1="La palabra 1 no tiene letra "+(i+1);}
				 
			else {cadena1="La palabra 2 no tiene letra "+(i+1);}
	        
			System.out.println("Letra "+(i+1)+" igual en las dos palabras? \n"+cadena1);
		
			
	        }//Cierre del bucle for	
		}//Cierre del metodo main
		}//Cierre de la clase comparadora